近日,鄭州大學(xué)董子鋼教授團(tuán)隊(duì)在國(guó)際知名雜志Nature Communications(自然通訊)在線發(fā)表題為“The comparison of cancer gene mutation frequencies between China and U.S.”的學(xué)術(shù)論文。該研究首次在中國(guó)人群中得到全癌癥譜腫瘤相關(guān)基因突變頻率,并通過與美國(guó)相關(guān)數(shù)據(jù)進(jìn)行比較分析發(fā)現(xiàn)TP53,EGFR等基因突變頻率在兩國(guó)有較大差異,并分析了其相關(guān)原因,結(jié)合腫瘤突變譜對(duì)我國(guó)腫瘤開展精準(zhǔn)靶向治療具有重要意義。鄭州大學(xué)博士研究生馬法洋和博士后Laster K.為該研究的共同作者,董子鋼教授為通訊作者。
該研究收集并整理分析了2004年至2016年中國(guó)國(guó)家癌癥中心共556萬的癌癥流行病學(xué)數(shù)據(jù)。文中分析了23種癌癥類型(共包括94種腫瘤亞型,11,948例癌癥患者)中382個(gè)腫瘤相關(guān)基因中可影響編碼蛋白序列的基因突變。通過把腫瘤基因測(cè)序數(shù)據(jù)與流行病學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行融合分析,得出在中國(guó)癌癥人群中排名前十的突變基因?yàn)門P53 (51.4%),LRP1B(13.4%),PIK3CA (11.6%), KRAS (11.1%), EGFR (10.6%), APC (10.5%), KMT2D (9.7%), KMT2C (8.8%), ARID1A (8.4%), and FAT4 (7.7%)。其中在中國(guó)人群中突變頻率最高的基因?yàn)門P53 (51.4%),即超過一半的癌癥患者的腫瘤組織攜帶有TP53突變。通過對(duì)中國(guó)的突變頻率與美國(guó)的癌癥基因突變頻率進(jìn)行對(duì)比分析發(fā)現(xiàn),中國(guó)癌癥患者TP53 (51.4%) 及 EGFR (10.6%) 等癌癥基因的突變頻率要遠(yuǎn)高于美國(guó)腫瘤患者的TP53 (34.0 %) 及 EGFR (3.1%)突變頻率。通過分析發(fā)現(xiàn)TP53的差異主要是來自于中國(guó)的非小細(xì)胞肺癌,胃癌,食管癌,及肝癌中TP53的高突變率。該研究通過性別及吸煙狀態(tài)的分層分析,發(fā)現(xiàn)EGFR的差異則主要來自于肺癌EGFR的高突變率,其中中國(guó)非吸煙女性的肺癌患者中EGFR的突變頻高達(dá)70.7%。
該研究報(bào)道了11948例中國(guó)腫瘤患者細(xì)胞突變情況,繪制了迄今為止中國(guó)人群中規(guī)模最大、最全面的腫瘤基因突變分析圖譜,并進(jìn)行全面比較分析和美國(guó)人群癌癥突變譜的差異,該研究不但明確了我國(guó)腫瘤獨(dú)特的突變譜,并為我國(guó)腫瘤患者開展精準(zhǔn)靶向治療提供重要的理論基礎(chǔ)。該研究得到國(guó)家自然科學(xué)基金委和河南省重大科技專項(xiàng)的支持。(孫常程 供稿)
文章鏈接: https://doi.org/10.1038/s41467-022-33351-4
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對(duì)比圖